İmmünolojik olmayanlar		İmmünolojik olanlar
Enzim defektleri	Malabsorpsiyon	Alerjiler	Otoimmün hastalıklar	Yalancı alerjiler
Laktoz intoleransı	Fruktoz malabsorpsiyonu	Tip I (Ani Tip)	Çölyak hastalığı	Gıda katkı maddesi
Fruktoz intoleransı	Fitosterol-Rezorpsiyon	Tip IV (Geç Tip)
Histamin intoleransı		Çapraz Alerjiler (İnhalasyon alerjenleri)

İmmünolojik olmayan gıda intoleransları

Gerçekte immünolojik olmayan yolla aracılık edilen reaksiyonlar tüm gıda advers reaksiyonlarının esas çoğunluğunu oluşturmaktadır.Ya gıdada bulunan karbonhidratların yeterince sindirilemediği enzim yetersizliklerinin sonucu olarak ortaya çıkarlar ya da sebep, malabsorpsiyon denen, karbonhidratların ince bağırsakta sadece sınırlı bir ölçüde emilebildiği emilim bozukluğunda yatmaktadır. Her iki durumda da karbonhidratlar bağırsağın, ozmotik olarak aktif olacakları daha derin kısmına doğru yollarını bularak, bakteri ayrıştırmasına bağlı gaza ve ishale neden olur.İmmün sistemin bu intolerans reaksiyonlarında bir rolü yoktur. Çünkü gıdadaki tüm içerikler immün sistem tarafından tolere edilmektedir. Avrupa nüfusunda aminlerin ve karbonhidratların sindiriminde ve emiliminde en sık rastlanan bozukluklar laktoz, fruktoz ve histamin intoleranslarıdır.

İmmünolojik gıda intoleransları

İmmünolojik olayların aracılık ettiği gıda intoleranslarında, yenen yemeklerin tüm bileşenleri sindirilebilir ve organizma tarafından emilebilir ancak belirli gıda içerikleri immün sistemin aktive olmasına neden olabilir. Dolayısıyla etkilenen kişinin immün sistemi normalde zararsız olan gıda içeriklerini tolere edemez.Tetiklenen advers inflamatuvar yanıtlar, patojenlere karşı biyolojik olarak faydalı olan savunmalarda da yer alan yanıtlara benzemektedir. İmmünolojik gıda intoleransları gıda alerjileri ve çapraz reaksiyonları, otoimmün olarak indüklenen çölyak hastalığını ve gıda katkı maddelerine karşı yalancı alerjik reaksiyonları kapsamaktadır.